山西农业大学研究生院历经研究生处、研究生学院，于2014年更为现名。设有综合办公室、招生办公室、培养办公室、质量评估与监督办公室、学位管理办公室、学科管理办公室等6个科室，承担全校研究生招生、培养、质量评估与监督、学位授予、学科管理工作。同时，学校设立党委研究生工作部，下设研究生管理办公室，全面负责研究生思想政治教育工作。

学校是首批获得硕士学位授权、第七批获得博士学位授权的高校之一。现有9个博士学位授权一级学科，1个博士专业学位授权类别，14个硕士学位授权一级学科，1个硕士学位授权二级学科，10个硕士专业学位授权类别；覆盖农学、理工、工学、法学和管理学等5个学科门类。现有动物遗传育种与繁殖1个国家重点（培育）学科，农业工程、作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、林学、草学等9个省级重点学科。农林经济管理、食品科学与工程、生物学和公共管理4个省级重点建设学科。植物学与动物学、农业科学、环境与生态科学三个学科进入ESI全球前1%。现有博士生导师278人、硕士生导师1384人，各类在校研究生5319人，其中博士生409人，硕士生4910人。

(数据统计至2025年4月)